תוכנה חדשה הופכת את CRISPR-methodology לקלה יותר

???? מה יקרה אם נחזור אחורה בזמן ב GTA V ונלך לרוח המסתורית? (פותרים את תעלומת הרוח ב GTA V!) (יולי 2019).

Anonim

מדענים ב Karolinska Institutet ואוניברסיטת גוטנברג יצרו תוכנה מבוססת אינטרנט, Green Listed, אשר יכול להקל על השימוש של מתודולוגיית CRISPR. התוכנה פורסמה בכתב העת ביואינפורמטיקה והוא זמין באופן חופשי דרך greenlisted.cmm.ki.se שבו גם טקסטים מידע וסרטים זמינים.

תאים קטנים מאוד ובונה אורגניזם. לאדם יש בערך פי 100 תאים רבים בגוף שלו כמו שיש אנשים על פני כדור הארץ. בתוך הרוב המכריע של תאים אלה הם שרשראות ארוכות של DNA. שרשראות הדנ"א משפיעות על מראה התאים השונים והתנהגותם. CRISPR היא שיטת מחקר שניתן להשתמש בה כדי ללמוד במהירות כיצד חלקים שונים של ה- DNA משפיעים ישירות על התאים. באמצעות שיטה זו, החוקרים יכולים לקבל תובנות על הגורם למחלות ולתת עצות כיצד ניתן לטפל בהם.

"אנו משתמשים במתודולוגיית CRISPR כדי לחקור תאי חיסון ותאי סרטן, במטרה לפתח טיפולים חדשים לחולים עם מחלות הקשורות למערכת החיסונית, כגון דלקת פרקים, וכן סרטן", אומר פרדריק ורמלינג במרכז מולקולרית רפואה (CMM), המחלקה לרפואה, מכון קרולינסקה.

Green Listed מפשט את העבודה עם המתודולוגיה של CRISPR

שיטת CRISPR מבוססת על מערכת הנמצאת באופן טבעי בחיידקים רבים והשיטה קיבלה תשומת לב רבה בשנים האחרונות. דרך חזקה מאוד לשימוש ב- CRISPR היא לבחון במקביל חלקים שונים של ה- DNA בו זמנית, מסך שנקרא CRISPR. "ירוק רשום" משמש במיוחד כדי להקל על סוג זה של מחקרים בקנה מידה גדול.

"על ידי יישום מתודולוגיית CRISPR במחקר שלנו, אנו יכולים כעת להסביר תופעות של ניסינו להבין במשך מספר שנים, זה קשור בעיקר ניסויים מסך CRISPR, שבו אנו במקביל לשנות מספר גדול של חלקים נבחרים של ה- DNA של תאים בודדים תוכנת Green Listed מפשטת תהליך זה באופן משמעותי, והיא חשובה מאוד להתקדמות שלנו ", אומר פרדריק ורמלינג.

הדנ"א הוא כמו ספר בישול

DNA הוא מושג מופשט חוקרים לעתים קרובות להשתמש. פרדריק מציע כי דרך לחשוב על דנ"א היא שזה דומה ספר בישול שבו תאים לשאת סביבם.

הסיבה לכך היא שהתאים המרכיבים אדם שונים, הם משתמשים במתכונים שונים של ספר הבישול בדרכים שונות.מחלות רבות יכולות להסביר במידה מסוימת את קיומם של שינויים בדנ"א של החולה שנפגע. בהתאם למטפורה של ספר הבישול, ניתן לראות זאת כאילו מתכון אחד או יותר בספר הבישול שונה, קל לדמיין שהמוצר הסופי שונה בתכלית, אם תשנה מתכון של ספר בישול, לדוגמה שינוי כף של סוכר לכף מלח, בשיטת CRISPR, אנו יכולים לבצע במהירות שינויים כאלה בתאים בודדים בודדים וללמוד על המחלות שאנו לומדים ", מסכם פרדריק.

הפרויקט נתמך מבחינה כספית על ידי מועצת המחקר השוודי, הקרן השוודית למחקר אסטרטגי, קרנות Wenner-Gren, יסודות הג'נסון, BILS (תשתית ביואינפורמטיקה לאומית למדעי החיים) ומכון קרולינסקה.

menu
menu